Survei Mikrobioma Rumah Sakit Chicago Yang Baru Dibuka
Survei Mikrobioma Rumah Sakit Chicago Yang Baru Dibuka – Studi 12 bulan yang memetakan keragaman bakteri di dalam rumah sakit – dengan fokus pada aliran mikroba antara pasien, staf, dan permukaan – akan membantu rumah sakit di seluruh dunia lebih memahami cara mendorong interaksi mikroba yang menguntungkan dan mengurangi kontak yang berpotensi berbahaya.
Survei Mikrobioma Rumah Sakit Chicago Yang Baru Dibuka
hospitalmicrobiome – “Proyek Mikrobioma Rumah Sakit adalah analisis mikrobioma tunggal terbesar dari sebuah rumah sakit yang dilakukan, dan salah satu studi mikrobioma terbesar yang pernah ada,” kata penulis senior studi Jack Gilbert , PhD, direktur Pusat Mikrobioma dan profesor bedah di Universitas Chicago dan pemimpin kelompok dalam Ekologi Mikroba di Argonne National Laboratory.
Melansir uchicagomedicine, “Kami telah membuat peta rinci, sangat relevan dengan praktik klinis, pertukaran mikroba dan interaksi di lingkungan rumah sakit yang besar,” katanya. “Ini menggambarkan ekologi sebuah bangunan, ekosistem mikroba yang berkembang yang secara teratur berinteraksi dengan pasien dengan cara yang tampaknya tidak berbahaya, setidaknya kebanyakan orang tampaknya tidak terpengaruh secara negatif. Ini memberi kita kerangka kerja, sesuatu yang dapat kita bangun, menunjukkan bagaimana mikroorganisme masuk dan menjajah lingkungan rumah sakit.”
Baca juga : Rumah Sakit Chicago Akan Ditutup
Penelitian, “Kolonisasi dan suksesi bakteri di rumah sakit yang baru dibuka,” dimulai dua bulan sebelum Universitas Kedokteran Chicago membuka rumah sakit barunya, Pusat Perawatan dan Penemuan , pada 23 Februari 2013, dan berlanjut selama 10 bulan setelahnya. Para peneliti, yang dipimpin oleh mahasiswa pascasarjana dan penulis pertama studi Simon Lax , mengumpulkan lebih dari 10.000 sampel. Mereka mampu mendeteksi DNA mikroba di 6.523. Ini berasal dari 10 ruang perawatan pasien dan dua ruang perawatan yang bersebelahan, satu merawat pasien bedah dan yang lainnya, di lantai yang berbeda, untuk pasien kanker.
Para peneliti menyeka setiap tangan, lubang hidung dan ketiak pasien, serta permukaan yang mungkin telah disentuh pasien, seperti pegangan tempat tidur atau gagang keran. Mereka mengumpulkan sampel ruangan tambahan dari berbagai permukaan, termasuk lantai dan filter udara. Setiap kamar dibersihkan setiap hari, dengan pembersihan yang lebih luas setelah setiap pasien pulang. Para peneliti juga mengumpulkan sampel dari staf perawat masing-masing unit, menyeka tangan mereka, sarung tangan, sepatu, meja pos perawatan, pager, kemeja, kursi, komputer, telepon rumah dan telepon seluler.
Perubahan paling nyata terjadi ketika rumah sakit dibuka, yang diikuti dengan upaya pembersihan yang ekstensif. Organisme bakteri seperti Acinetobacter dan Pseudomonas, berlimpah selama konstruksi dan persiapan pra-pembukaan, dengan cepat digantikan oleh mikroba terkait kulit manusia seperti Corynebacterium, Staphylococcus dan Streptococcus, yang dibawa oleh pasien.
“Sebelum dibuka, rumah sakit ini memiliki keragaman bakteri yang relatif rendah,” kata Gilbert. “Tapi begitu diisi dengan pasien, dokter dan perawat, bakteri dari kulit mereka mengambil alih.”
Serangkaian perubahan kedua, dan berkelanjutan, mengikuti setiap pasien masuk rumah sakit. Pada hari pertama pasien di rumah sakit, mikroba cenderung berpindah dari permukaan kamar pasien – rel tempat tidur, meja, gagang keran – ke pasien. Tetapi pada hari berikutnya dan setiap hari berikutnya, mikroba yang lebih banyak bergerak ke arah lain, dari pasien ke ruangan, terus menambah keragaman mikroba pada permukaan di dalam ruangan.
“Pada hari kedua mereka tinggal,” kata Gilbert, “rute penularan mikroba terbalik. Dalam 24 jam, mikrobioma pasien mengambil alih ruang rumah sakit.” Ada dua temuan yang tidak terduga.
Pertama, ketika panas dan kelembaban meningkat selama musim panas, anggota staf berbagi lebih banyak bakteri satu sama lain. Kedua, ketika mereka mengukur dampak perawatan – seperti antibiotik sebelum atau selama masuk rumah sakit, kemoterapi selama masuk, operasi, atau masuk rumah sakit melalui unit gawat darurat – dampaknya minimal.
“Kami secara konsisten menemukan bahwa antibiotik yang diberikan secara intravena atau melalui mulut hampir tidak berdampak pada mikrobioma kulit,” kata Gilbert. “Tetapi ketika seorang pasien menerima antibiotik topikal, maka, seperti yang diharapkan, itu menghapus mikroba kulit.”
Sampel dari 92 kamar pasien yang tinggal di rumah sakit lebih lama, diukur dalam beberapa bulan, mengungkapkan tren. Beberapa bakteri yang berpotensi berbahaya, seperti Staphylococcus aureus dan Staphylococcus epidermidis , dihadapkan dengan tekanan selektif terus-menerus, berhasil memperoleh gen yang dapat meningkatkan resistensi antibiotik dan meningkatkan infeksi inang.
“Ini membutuhkan studi lebih lanjut,” kata Gilbert, “tetapi jika itu terbukti benar, maka perubahan genetik ini dapat memengaruhi kemampuan bakteri untuk menyerang jaringan atau menghindari perawatan standar.”
Studi yang diterbitkan 24 Mei di Science Translational Medicine , “menunjukkan sejauh mana ekologi mikroba kulit pasien dan permukaan rumah sakit saling terkait dan dapat memberikan konteks untuk studi masa depan tentang penularan infeksi yang didapat di rumah sakit,” para penulis menyimpulkan.
Studi ini didanai oleh Alfred P. Sloan Foundation Microbiology dari Built Environment Program dan Departemen Energi Amerika Serikat. Penulis tambahan adalah Simon Lax, Naseer Sangwan, Peter Larsen, Kim M Handley, Miles Richardson, John Alverdy, Kristina Guyton, Monika Krezalek, Benjamin Shogan, Jennifer Defazio, Irma Flemming, Baddr Shakhsheer, Stephen Weber, Emily Landon dan Sylvia Garcia-Houchins dari Universitas Chicago dan/atau Laboratorium Nasional Argonne; Daniel Smith dari Baylor College of Medicine; Jeffrey Siegel dari Universitas Toronto; Rob Knight dari Universitas California, San Diego; dan Brent Stephens dari Institut Teknologi Illinois.
