Penelitian Ekologi Mikroorganisme Bakteria

Penelitian Ekologi Mikroorganisme Bakteria – Bakteri adalah bagian penting dari ekosistem. Mereka sangat penting untuk kesehatan kita dan lingkungan, memiliki peran penting dalam produksi makanan dan menyediakan alat bagi para bioengineer untuk memanfaatkan properti mereka dan membuat senyawa. Namun, mereka juga bisa berbahaya, menyebabkan kerusakan dan penyakit. Oleh karena itu, kemampuan untuk menumbuhkan mikroba ini merupakan langkah penting untuk dapat memanfaatkan kekuatan mereka, mengidentifikasi penyebab berbahaya dan memajukan pemahaman dan kemampuan kita. Pada artikel ini, kami mempertimbangkan apa itu kultur bakteri, faktor-faktor yang mempengaruhi kondisi kultur, masalah umum dan beberapa aplikasi yang banyak.

Penelitian Ekologi Mikroorganisme Bakteria

Apa itu kultur bakteri?

hospitalmicrobiome  – Kultur bakteri adalah metode yang memungkinkan perbanyakan sel bakteri di dalam atau pada media kultur di bawah kondisi laboratorium yang terkendali. Kondisi pasti yang diperlukan untuk replikasi optimal akan bergantung pada spesies bakteri target.

Baca Juga : SMART Peneliti Pioneer Cara Baru untuk Mendeteksi Kontaminasi Mikroba pada Kultur Sel

Apa perbedaan antara kultur aerobik vs kultur anaerob?

Sebagian besar bakteri dapat tumbuh sampai batas tertentu dengan adanya oksigen, yang dikenal sebagai kultur aerobik . Namun untuk pertumbuhan yang optimal, kondisi tersebut harus disesuaikan dengan bakteri target. Spesies yang ditemukan dalam kondisi atmosfer, seperti di permukaan kulit atau di saluran pernapasan bagian atas, biasanya akan tumbuh dengan baik jika ada oksigen. Spesies yang secara alami ditemukan di lingkungan dengan oksigen rendah, seperti luka dalam atau abses atau laut dalam, biasanya akan tumbuh paling baik tanpa adanya kultur oksigen-anaerobik .

Beberapa tidak dapat tumbuh dengan adanya oksigen sama sekali, dan ini disebut anaerob obligat . Contohnya termasuk Fusobacterium dan Bacteroides. 1 Demikian juga, yang tidak dapat tumbuh tanpa oksigen disebut aerob obligat . Contoh untuk keperluan kultur termasuk Gram negatif Pseudomonas aeruginosa 2 dan Mycobacterium tuberculosis , 3 agen penyebab tuberkulosis. Namun, penelitian menunjukkan bahwa keduanya dapat melakukan respirasi anaerobik dalam keadaan tertentu. Bakteri yang dapat tumbuh baik dalam kondisi aerob maupun anerob, beralih dari respirasi aerob ke fermentasi atau respirasi anaerob jika oksigen tidak ada, disebut anaerob fakultatif . Contohnya termasuk stafilokokus Gram positif , 4 Escherichia coli ( E. coli ), 5 Salmonella 6 dan Listeria spp.. 7

Metode kultur bakteri

Agar berhasil dikulturkan, bakteri memerlukan pemberian nutrisi dalam media kultur. Ada banyak formulasi berbeda yang tersedia untuk memenuhi kebutuhan nutrisi spesies bakteri yang berbeda. Jenis media yang Anda pilih akan bergantung pada tujuan budaya. yang kaya, bernutrisi, atau Media lengkap dapat membantu saat mencoba menumbuhkan biakan murni dan mendapatkan sel bakteri dalam kondisi baik.

Media minimal di sisi lain hanya akan memasok kebutuhan dasar untuk bertahan hidup dan dapat berguna dalam memanipulasi jalur mana yang diaktifkan pada bakteri. Media juga dapat digolongkan sebagai defined atau undefined . Seperti namanya, dalam media yang ditentukan, semua bahan diketahui. Media yang tidak terdefinisi cenderung mengandung campuran kompleks nutrisi dan spesies kimia dalam proporsi yang tidak diketahui, seperti ekstrak ragi. Apapun media yang dipilih, ini mungkin dalam bentuk cair sebagai biakan kaldu , atau agar dapat ditambahkan untuk mengatur media dan membiarkan sel bakteri tumbuh di permukaan padat.

Kaldu budaya

Kultur dalam media cair, juga dikenal sebagai kultur kaldu, memberi bakteri akses mudah ke nutrisi yang tersedia dibandingkan dengan koloni bakteri statis. Agitasi lembut untuk menjaga agar bakteri tetap menyebar melalui media selama inkubasi dapat membantu akses ini lebih jauh. Media cair juga akan mengencerkan produk limbah saat terbentuk, mendistribusikannya melalui kultur. Akibatnya, massa bakteri yang lebih besar dapat diperoleh untuk volume cairan yang setara dibandingkan dengan media padat.

Oleh karena itu Anda mungkin ingin menggunakan biakan kaldu saat bertujuan untuk memperbanyak biakan Anda, misalnya saat menggunakan bakteri untuk menghasilkan senyawa yang diinginkan, dalam produksi makanan atau untuk mengekstraksi DNA atau plasmid. Saat ingin menyimpan strain bakteri dalam jangka panjang , mereka dapat dibiakkan di media cair. Gliserol kemudian ditambahkan, yang akan mencegah pembekuan total dan lisis sel bakteri, memungkinkan penyimpanannya pada -80 ° C. Penyimpanan jangka panjang dengan cara ini mempertahankan strain membantu saat mengumpulkan strain dalam jangka waktu yang lama mencegah hilangnya galur yang berharga dan juga mengurangi risiko mutasi yang mungkin terjadi akibat lewat berulang.

Agar nutrisi

Menambahkan agar ke media cair memungkinkannya diatur dalam cawan petri, sebagai lereng atau sumbat misalnya. Media padat berguna saat Anda ingin memilih koloni individu dari kultur campuran, misalnya saat memurnikan sampel diagnostik. Jika Anda ingin menghitung jumlah unit pembentuk koloni (cfu) dalam volume sampel cairan tertentu, pelapisan dan inkubasi pada media padat juga memungkinkan. Inokulasi ke lereng atau kultur tusuk juga dapat menjadi metode yang nyaman untuk memindahkan strain dari lab ke lab tanpa bahaya tumpahan bahan yang berpotensi menular.