Mapping Mikroorganisme di Balik Infeksi
hospitalmicrobiome – Pada Januari 2013, saat University of Chicago bersiap untuk mengungkap gedung rumah sakit terbarunya, satu tugas terakhir tersisa: membersihkan sudut dan celah gedung, dari lantai ke furnitur hingga keran air.Orangorang yang melakukan swabbing adalah peneliti yang mengumpulkan sampel mikroorganisme—bakteri, jamur, dan virus yang pada dasarnya ada di manamana, termasuk di dalam dinding rumah sakit. Sebagai bagian dari inisiatif yang disebut Proyek Mikrobioma Rumah Sakit , para peneliti ini kembali ke rumah sakit sepanjang tahun untuk mengumpulkan hampir 12.400 sampel, dengan tujuan memetakan campuran mikroba yang mengisi lingkungan perawatan kesehatan.
Mapping Mikroorganisme di Balik Infeksi – Sama seperti usus manusia yang memiliki mikrobioma, begitu juga rumah sakit, tim tersebut mengemukakan. Mereka termasuk di antara kelompok peneliti yang berkembang yang percaya bahwa memahami komunitas ekologi mikroskopis rumah sakit dapat menjadi kunci untuk mencegah orang menjadi lebih sakit di rumah sakit ketika mereka seharusnya pulih. Mikrobioma usus kita telah dikaitkan dengan efek mulai dari penyakit Parkinson hingga respons imun tubuh ; beberapa ilmuwan percaya bahwa mikrobioma rumah sakit juga dapat berperan dalam kesehatan.Bukan rahasia lagi bahwa infeksi terkait perawatan kesehatan memiliki biaya kesehatan dan ekonomi yang besar.
Mapping Mikroorganisme di Balik Infeksi
Diperkirakan 440.000 infeksi terjadi setiap tahun di rumah sakit AS, menelan biaya hampir $ 10 miliar. Dan meskipun ada upaya untuk menjaga kebersihan gedung dan tangan serta peralatan pekerja, penyakit itu terus berlanjut. “Ada banyak penyakit inferior yang tidak dapat dijelaskan (sepsis, infeksi) yang terjadi di rumah sakit. Kami dapat mengidentifikasi bakteri yang paling terkait dengan kejadian ini, tetapi rincian infeksi mikroba di rumah sakit belum diketahui. Hmm.” Jack Gilbert, pemimpin Proyek Mikrobiologi Rumah Sakit dan ahli ekologi mikroba di Argonne National Laboratory.
Untuk menjawab pertanyaan ini, tim mengumpulkan sampel dari dua ruang perawatan dan beberapa lokasi di 10 kamar rumah sakit di gedung rumah sakit baru. Mereka membersihkan area ini sebelum gedung mulai menerima pasien dan pada tahun pertama setelah ruangan itu ditempati. Para peneliti mengambil sampel mikroba di udara rumah sakit dan di tubuh anggota staf; mereka juga mengumpulkan informasi lingkungan seperti kelembaban dan konsentrasi karbon dioksida untuk mengawasi jumlah penghuni manusia sepanjang siang dan malam. Sebagai komponen proyek yang terpisah, para peneliti mengukur variabel serupa di satu kamar pasien di rumah sakit Angkatan Darat AS di Jerman.
Itu bukan pemeriksaan pertama mikroorganisme yang hidup di gedunggedung. Pada tahun 1887, Thomas Carnelley menyelidiki kuman di udara di sekolah, selokan, dan rumah di Dundee, Skotlandia. Dan barubaru ini, tim peneliti lain memeriksa mikroba di unit perawatan intensif neonatal rumah sakit . Namun, proyek Chicago berskala lebih besar, sebagian dimungkinkan oleh kemajuan terbaru dalam teknologi pengurutan gen yang memfasilitasi pemrosesan banyak sekali sampel. Dan proyek ini adalah yang pertama tidak hanya untuk mengidentifikasi jenis mikroorganisme—ramah atau patogen—tinggal di rumah sakit, tetapi untuk mengukur bagaimana lokasi dan faktor lingkungan, seperti kelembaban, ventilasi, dan lalu lintas pejalan kaki, dapat membentuk populasi ini dari waktu ke waktu.
“Jika Anda dapat memahami pola komposisi komunitas mikroba dan bagaimana perubahan ini dari waktu ke waktu, Anda bisa mendapatkan ide yang cukup bagus tentang bagaimana mencegah beberapa transmisi organisme patogen,” kata John Chase, yang telah meneliti mikrobioma di Northern Arizona. Universitas dan tidak terlibat dalam Proyek Mikrobioma Rumah Sakit.
Misalnya, baik di usus atau di gedung, hanya sebagian kecil bakteri dalam mikroflora yang menimbulkan risiko infeksi. Sisanya adalah pengamat (kadang disebut penyusup) atau menguntungkan. Namun, banyak perawatan yang diterima pasien, seperti kemoterapi dan antibiotik, dapat mengubah campuran mikroorganisme ini, mengubah bakteri dan jamur yang umumnya tidak berbahaya menjadi patogen.
“Kami secara tradisional berasumsi bahwa satu-satunya organisme di rumah sakit adalah yang menyebabkan penyakit, dan jika terdeteksi, pasien berisiko terinfeksi,” kata Gilbert. .. “Tetapi data untuk mendukung ini sangat kurang.”
“Ketika Anda memasuki ruangan, Anda mengambil mikroba, dan ruangan mengambil mikroba dari Anda.”
Sebaliknya, infeksi nosokomial adalah bakteri “jahat”. mengatakan itu mungkin karena kehadirannya. Lagi pula, banyak orang yang bekerja di bidang medis tanpa sadar membawa patogen potensial ke sistem pencernaan dan kulit. Namun tidak seperti pasien yang lemah atau terganggu, mereka tidak jatuh sakit karena mereka dilindungi dari infeksi parah oleh sistem kekebalan mereka dan mikroba lain yang hidup di sana.
Baca Juga : Proyek Penelitian Mikroba
Hasil proyek belum dipublikasikan, tetapi Brent Stephens, Kolaborator Mikrobioma Rumah Sakit, mengungkapkan bahwa jenis bakteri tertentu yang biasa ditemukan pada kulit manusia, seperti beberapa spesies staphylococcus , streptococcus, dan corynebacterium , menjadi jauh lebih melimpah setelah rumah sakit. dibuka. Sementara itu, Pseudomonas , yang dapat menyebabkan infeksi kandung kemih, luka, dan paruparu, dan yang lebih jarang menjadi kolonisasi kulit, menjadi kurang banyak. Itu menunjukkan lingkungan rumah sakit dan manusia di dalamnya berbaur dengan cara yang mendorong pertukaran bakteri.
Ini sesuai dengan penelitian sebelumnya, yang telah menunjukkan bahwa manusia menyimpan dan memperoleh kenangkenangan mikroba dari bangunan melalui kulit. “Anehnya dengan cepat, ketika Anda memasuki sebuah ruangan, Anda mulai mengambil mikroba, dan ruangan itu mengambil mikroba dari Anda,” kata Daniel Freedberg, seorang ahli gastroenterologi dan asisten profesor kedokteran di Columbia University Medical Center di New York City.
Freedberg percaya peta mikrobioma rumah sakit—sesuatu yang menggambarkan permukaan tempat berkembang biaknya serangga tertentu—dapat memberikan wawasan berharga tentang kondisi lingkungan yang memungkinkan mikroba berkembang. Dia memimpin penelitian terbaru yang menunjukkan lingkungan rumah sakit memang bisa berperan dalam penularan infeksi . Penelitian tersebut mengaitkan pewarisan tempat tidur rumah sakit dari seorang pasien yang telah menerima antibiotik dengan risiko lebih tinggi terkena diare menular yang berpotensi mematikan yang disebabkan oleh clostridium difficile , bakteri yang sporanya tumbuh subur di usus manusia ketika bakteri normal telah dihancurkan oleh antibiotik.
Penelitian ini tidak mengidentifikasi alasan hubungan antara antibiotik dan infeksi, tetapi obat yang diterima oleh satu pasien mengubah pleksus usus, dan campuran serangga yang dimodifikasi ini diteruskan ke pasien berikutnya. Saya menunjukkan kemungkinan bahwa hal itu dilakukan . Predisposisi c untuk pasien kedua ini di tempat tidur. sulit . Atau, pasien dapat langsung menginfeksi pasien berikutnya dengan bakteri melalui kasur atau tempat tidur. Staf rumah sakit membersihkan tempat tidur di antara pasien, tetapi c. Spora sulit terkenal karena sulit dibunuh. (Di sisinya, Gilbert tidak yakin bahwa kebersihan saja dapat menghilangkan infeksi rumah sakit.) Kedua penjelasan tersebut menunjukkan efek dan metode mengubah flora usus dari satu pasien ke pasien lainnya.
